RNA的“脱磷剂”——RNA 5´ Polyphosphatase

酶是一类极为重要的生物催化剂。之前小达君给大家安利了只针对线性RNA的RNase R（RNaseR——RNase家族的“外貌协会成员”），今天继续给大家介绍另一位RNase家族的“奇葩成员”，它能够从5´-三磷酸化的RNA依次地移除γ和β磷酸基，简直就像RNA的“脱磷剂”，可以一层一层地“剥开”RNA的磷~

RNA 5´ Polyphosphatase是Epicentre科学家发现的一个Mg2+依赖的磷酸水解酶。该酶能够从5´-三磷酸化的RNA (如初级RNA转录本) 依次地移除γ和β磷酸基：

5´ pppN—OH 3´ → 5´ pN—OH 3´ + 2 Pi

带有5´-双磷酸化末端的RNAs也可以通过RNA 5´ Polyphosphatase转化成5´-单磷酸酶化的RNA：

5´ ppN—OH 3´ → 5´ pN—OH 3´ + Pi

RNA Polyphosphatase对含有5´帽子(例如, 5´ m7GpppN—OH 3´)或5´单磷酸化末端(5´ pN—OH 3´)的RNA没有活性。但是NTPs和dNTPs都是该酶的底物，产生相应的NMPs和dNMPs + 无机磷:

(d)NTP → (d)NMP + 2Pi 

应用

• 将5´三磷酸化的RNA转换成5´单磷酸化的RNA，用于使用T4  RNA Ligase的5´-RNA连接标记反应；

• 分析RNA的5´末端结构；

• 用于制备RNA底物，后续可用于Terminator™ 5´-磷酸依赖性外切核酸酶的降解反应。

产品信息

美国Lucigen公司成立于1998年，提供各类用于分子生物学相关产品，可以使研究者成功克隆较难克隆的基因，其在2016年收购了Illumina旗下Epicentre产品线。目前产品类别主要包括：体外转录、基因克隆（BAC克隆试剂盒）、感受态细胞（TG1噬菌体文库构建感受态）、体外扩增、转座子突变、蛋白表达、文库构建等。